Pelo menos 20% das microbacias da Amazônia sofrem alto impacto de atividades ou infraestruturas que ocorrem ao seu redor, como hidrelétricas, mineração, garimpo ilegal, estradas e agropecuária. É o que mostra o Índice de Impacto nas Águas da Amazônia, da Ambiental Media. Foram analisados 11.216 microbacias da Amazônia Legal, dessas, 2.299 apresentam um impacto tido como alto.
As áreas mais impactadas são a do Madeira, que tem a hidrelétrica Canaã, em Rondônia; a do Tapajós, com a hidrelétrica Braço Norte, em Mato Grosso e a do Xingu, região da hidrelétrica de Belo Monte, no Pará. Segundo o levantamento, a bacia do Rio Içá é o corpo d’água do Rio Amazonas que mais sofre com mineração, com impacto em 63% do percurso.
